Nat Genet： 人类癌症之中病毒分布

德国肺癌研究中心 Peter Lichter 团队最新研究探索了生物肺癌中菌株的分布。日前《自然—病毒学》因特网发表了这一成果。

作为泛癌正因如此真核生物分析方法联盟的一部分，该元数据资料收集了 38 个类型的 2658 例肺癌样本的正因如此真核生物和一部分激活正因如此真核生物脱氧核糖核酸数据资料，研究人员利用共识的方法，建构了 3 个独立元数据资料并用行之有效研究潜在的菌株病原体。在 382 个真核生物和 68 个激活组数据资料集中都测定到了菌株存在。研究发现，仅有的与相关的菌株，如爱泼斯坦—巴尔菌株（EBV）、乙型肝炎菌株（HBV）和人瘤菌株（HPV）的检出率都极高。

这项研究概述了躯干癌中 HPV 和驱动基因基因型的显着实体以及 HPV 与 APOBEC 基因型特征的相关性，这表明抗菌株战斗力下降是宫颈癌、膀胱癌和躯干癌的各种因素。对于 HBV、HPV16、HPV18 和腺相关菌株 2，菌株建构与真核生物拷贝数的局部变化有关。在 TERT 启动子处的建构与遗传物质的高表达有关，从而明显激活了该的发育全过程。内源性逆激活菌株的高表达与肺癌患者较高的生存期有关。

原始出处：

Zapatka， M.， Borozan， I.， Brewer， D.S. et al. The landscape of viral associations in human cancers. Nat Genet (2020). https：//doi.org/10.1038/s41588-019-0558-9.